Jetra igrajo ključno vlogo pri pretvorbi T4 v T3 in s tem vplivajo na delovanje ščitnice ter presnovo.
Oslabljena jetra, predvsem zaradi debelosti, zmanjšajo učinkovitost pretvorbe T4 v T3 in povzročijo presnovne težave.
Levotiroksin, standardno zdravilo za hipotirozo, je odvisen od delovanja jeter, zato pri nekaterih bolnikih ni učinkovit.
Povišana raven estrogena glede na progesteron (relativno ali absolutno) pomembno zavira jetra, zlasti pri ženskah.
Neravnovesje med T3 in rT3 lahko povzroči simptome, podobne hipotirozi, zlasti pri bolnikih s presnovnim sindromom.
Jetra opravijo izjemno delo – vsak dan pretvorijo 60% neaktivnega ščitničnega hormona T4 v aktivno obliko T3. Predstavljaj si jetra kot tovarno, kjer se iz surovine (T4) izdela končni izdelek (T3), ki ga celice dejansko lahko uporabijo. Brez te pretvorbe lahko jemleš tableto levotiroksina vsako jutro, a bo vseeno ostala le neporabljena surovina v telesu. Učinek pa v najboljšem primeru zmeren.
Pretvorba T4 v T3 ni pomembna samo za ljudi, ki jemljejo hormonske nadomestke. Jetra opravljajo pretvorbo neprestano, ne glede na to, ali imaš diagnosticirano hipotirozo ali ne. Jetrne celice - hepatociti, vsebujejo posebne encime – dejodinaze – ki odstranijo jodov atom iz molekule T4 in ustvarijo biološko aktiven T3. Če delujejo slabo, celice preprosto ne dobijo dovolj aktivnega hormona.